Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgbd1E9Q492 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms