Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms