Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp1E9Q368 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms