Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms