Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Zfp558E9Q1J0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp558E9Q1J0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms