Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms