Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms