Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms