Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp54bE9PXC0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms