Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms