Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms