Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcn1E9PVA8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gcn1E9PVA8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcn1E9PVA8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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