Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifit3bE9PV48 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms