Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms