Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm5478D3Z6R0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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