Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms