Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms