Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms