Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms