Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms