Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cttnbp2B9EJA2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms