Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26c1B2RXA7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26c1B2RXA7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms