Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap58B2RW38 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap58B2RW38 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms