Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7aB2RT54 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms