Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035947B2RQY6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035947B2RQY6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms