Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms