Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930402K13RikB1AW18 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930402K13RikB1AW18 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930402K13RikB1AW18 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930402K13RikB1AW18 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930402K13RikB1AW18 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930402K13RikB1AW18 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930402K13RikB1AW18 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930402K13RikB1AW18 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930402K13RikB1AW18 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms