Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms