Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms