Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatsperbA2RTF1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms