Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Klhl41A2AUC9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms