Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scn3aA2ASI5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scn3aA2ASI5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms