Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CtcflA2APF3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtcflA2APF3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms