Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll9A2APC3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms