Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syndig1A2ANU3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms