Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabreA2AMW3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms