Protein–RNA interactions for Protein: A2ABG4

Tbc1d16, TBC1 domain family, member 16, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d16A2ABG4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tbc1d16A2ABG4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms