Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700023F06RikA2AB62 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms