Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pramef6A2A8M8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms