Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trav12-2A0N8N6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trav12-2A0N8N6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trav12-2A0N8N6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trav12-2A0N8N6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trav12-2A0N8N6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trav12-2A0N8N6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trav12-2A0N8N6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trav12-2A0N8N6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trav12-2A0N8N6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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