Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms