Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A0A0U1RNP2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms