Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Scn2aA0A0J9YTW6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn2aA0A0J9YTW6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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