Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trbv26A0A0B4J1P5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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