Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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