Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms