Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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