Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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FOXE3Q13461 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXE3Q13461 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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