Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms