Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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